Marius Lunde ble født i Japan i 1985. I 1989 flyttet han til Norge sammen med sin norske far og japanske mor, men etter et år reiste moren tilbake til Japan, og kuttet all kontakt med familien. Kodenavn: Nagasaki skildrer Marius’ forsøk på å reetablere kontakten med moren i voksen alder og forstå hvorfor hun forlot ham, og den gjør det på svært utradisjonelt vis: Med seg på reisen til Japan har han nemlig bestekompisen og filmskaperen Fredrik S. Hana, og sammen gjør de jakten på Marius’ forsvunne mor til en lek med filmatiske virkemidler og en reise gjennom filmsjangre, fra film noir til tegnefilm. Dette er en film om familie, opphav og savn, men også om hvordan film lærer oss å forstå og kontekstualisere følelser og opplevelser.