Filmen utspiller seg i Sovjetunionen under Stalins brutale utrenskninger på 1930-tallet. Den unge og pliktoppfyllende statsadvokaten Alexander Kornev mottar et brev skrevet med blod fra en fange som hevder å være uskyldig dømt av regimet. Drevet av samvittighet og idealisme oppsøker han fengselet og krever svar, men etterforskningen trekker ham stadig dypere inn i et lukket og truende maktapparat preget av frykt, løgner, korrupsjon og vilkårlig vold. Gjennom intense møter med vakter, byråkrater og NKVD-agenter settes både idealene, motet og sikkerheten hans på spill. To anklagere er et nervepirrende og tankevekkende drama om lojalitet, mot, naivitet og prisen for å tro på rettferdighet i et totalitært regime.